I alla system som bär vätskor är täta anslutningar och packningar mycket viktiga, särskilt i system som är i nära anslutning till elektricitet eller elektronik då kortslutningar inte bara kan orsaka skador på komponenterna utan även dödliga stötar och bränder. Därför är det viktigt att välja slangar eller rör av rätt storlek till de anslutningar som vattenkylningssystemet har, så att allting kan sluta tätt utan läckage.
Om man använder metallrör som estetiskt val för sitt vattenkylningssystem bör man vara medveten om riskerna med att blanda olika metaller, då några kan orsaka korrosion vid nära kontakt med varandra om deras elektriska potentialskillnad är för stor. De agerar då nästan likt ett batteri, med elektroner som flödar från den ena metallen till den andra, vilket orsakar korrosion som kan leda till läckage. Det är i så fall bättre att hålla sig till bara en metall eller särskild legering när man utformar sitt system. Kopplingar av mässing och koppar ska inte blandas med rör av aluminium eller lod bestående av tenn, exempelvis.
Många anslutningar är utformade för att skruvas ihop, och i och med detta bör man hålla i åtanke att inte skruva åt för hårt. Det är bättre att förlita sig på en bra packning än att dra sönder gängorna på endera änden av kopplingen.
Packningar består av flexibla material såsom gummi eller silikon eftersom dessa kan komprimeras vid kontakt och därmed skapa tät kontakt mellan två lager av metall eller andra hårda material. Detta är viktigt, eftersom metall krymper och expanderar vid temperaturförändringar, visserligen inte markant vid temperaturintervallerna som är normala inuti en dator, men ändå tillräckligt för att skapa läckage över tid om det inte finns något fjädrande material mellan som kan anpassa sig efter dessa fluktuationer. Se till att alla kopplingar har en packning någonstans, på den ena eller andra anslutande komponenten, så att du kan känna dig trygg över att systemet inte bör läcka.